醫用超純水機設備采用全自動控制（同時亦可采用手動控制），系統運行時可設定自動反洗、再生程序；一級反滲透和二級反滲透設有回流管道，反滲透設備設有化學清洗裝置和消毒裝置。
醫用超純水機設備選購原則：
1、了解自己產水的用途，因為不同行業對產水水質要求是不盡相同的，據此可以確定用水的電導率要求，從而大致確定設備類型。
2、了解自己所在區域的水源和水質情況，根據原水類型確定設備所屬大類。根據原水硬度、泥沙懸浮物含量等指標確定是否需要另外選配預處理器。
3、了解自己對取水方式和取水量、安裝擺放、產品外觀的需求，根據以上的需求來選擇適合您的超純水設備。
4、了解服務商的安裝服務和售后服務,在購買產品時務必要重視安裝和售后服務的問題，選擇能提供正規的安裝服務的銷售渠道購買產品。
5、了解產品后續更換濾芯耗材的成本和方式,設備是需要長期使用的，基本上都需要后期維護和更換耗材，因此在購買時請綜合比較，咨詢清楚濾芯耗材的問題和相應的費用。
設備操作維護使用：
一是要按正確流程進行機器使用操作，二是做好它的維護保養工作，使其工作性能更加穩定，在超純水機中過濾水質的濾芯都是屬于消耗品，都是有一定的使用壽命的，因此如果沒有及時更換耗材，會導致整個系統工作狀態不佳，從而性能慢慢下降。所以在日常的系統使用中要加強對機器的性能指標監督發現問題及時解決。如定期進行設備的反滲透清洗可以排出設備中殘留的污染物，延長純水機的使用壽命。
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